295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3194 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 362 aa  741    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.96 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  23.81 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  26.94 
 
 		 642 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 1398 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  30.37 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 831 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  20.54 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  25.78 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  25.45 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  28.17 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  24.07 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  26.92 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.82 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.67 
 
 		 1635 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  24.54 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 383 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  26.55 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2075  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 1915 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  24.7 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 1261 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  24.6 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  27.66 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  45.31 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 1332 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>