174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2598 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 418 aa  869    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  44.29 
 
 		 409 aa  349  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  39.16 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  38.98 
 
 		 407 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  40.85 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  26.72 
 
 		 642 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  31.07 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  31.99 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  31.7 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 407 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  25.1 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 		 765 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  25.11 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  24.2 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 435 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 435 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 1770 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  25.12 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  24.36 
 
 		 501 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  21.51 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  20.08 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0981  glycosyl transferase WboA  21.82 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  22.9 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  20.4 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  35.71 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  19.89 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 366 aa  50.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  24.76 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  30.2 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  21.26 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  20.69 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  21.55 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 821 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  22.08 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  29.53 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  29.53 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  29.53 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>