60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3130 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
765 aa  1592    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0981  glycosyl transferase WboA  34 
 
 
410 aa  225  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0522  perosamine synthetase WbkB  36.24 
 
 
284 aa  140  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0518  wbkB protein  36.24 
 
 
284 aa  140  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3154  hypothetical protein  27.54 
 
 
429 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
402 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
418 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2123  hypothetical protein  20.48 
 
 
420 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0336198  normal  0.0777783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
393 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 
407 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
372 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
410 aa  58.9  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
386 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
409 aa  57.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
383 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
383 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
417 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
376 aa  55.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
349 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
358 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
361 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
383 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
369 aa  51.6  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
361 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
394 aa  51.2  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
355 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
371 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  23 
 
 
364 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
346 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 
354 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
358 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
435 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
380 aa  49.3  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  23.77 
 
 
407 aa  49.3  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
358 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
340 aa  48.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.65 
 
 
369 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
366 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 
387 aa  47.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
383 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  24.18 
 
 
460 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  24.18 
 
 
460 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
431 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
382 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
375 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
370 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  23.24 
 
 
404 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
361 aa  46.2  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  20.93 
 
 
359 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  20.93 
 
 
359 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  20.93 
 
 
359 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
423 aa  44.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
384 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
443 aa  44.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  33.33 
 
 
368 aa  44.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  23.79 
 
 
353 aa  44.3  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 
455 aa  44.3  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
346 aa  44.3  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  22.87 
 
 
346 aa  44.3  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  21.92 
 
 
428 aa  43.9  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>