127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2575 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 409 aa  842    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  44.29 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  37.47 
 
 		 407 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  34.38 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  38.21 
 
 		 642 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  30.63 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  31.8 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  29.33 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  23.21 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.43 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 361 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 765 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  26.79 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  24.67 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 370 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25 
 
 		 374 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  25.25 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  21.52 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0981  glycosyl transferase WboA  21.98 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  24.26 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2616  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 524 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3008  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 524 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2778  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 371 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  25.58 
 
 		 336 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 		 370 aa  46.6  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 821 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  23.74 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2339  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>