246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3288 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  819    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  47.24 
 
 
394 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
387 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  33.52 
 
 
391 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  31.9 
 
 
389 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
385 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
394 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  41.3 
 
 
642 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  30.53 
 
 
407 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  30.43 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
393 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.81 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  24.78 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.57 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1887  mannosyltransferase  26.85 
 
 
430 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5581  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641889  normal  0.0686664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
817 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.54 
 
 
346 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 
361 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3832  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.175097  normal  0.13882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
364 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
366 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
850 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  20.6 
 
 
370 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
355 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  21.21 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
1267 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
409 aa  56.6  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
369 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  23.23 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
374 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  19.05 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
440 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  21.91 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
364 aa  53.5  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  18.35 
 
 
375 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
355 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  23.73 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>