118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0313 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0313  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 410 aa  854    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.448937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2969  WbdP  44.12 
 
 		 404 aa  349  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.640876  hitchhiker  0.0000040837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2598  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2575  glycosyl transferase group 1  38.05 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2768  putative glycosyl transferase  35.68 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0377  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.82002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1853  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2887  putative glycosyl transferase  35.19 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  32.53 
 
 		 642 aa  149  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3288  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0851  a-glycosyltransferase  31.42 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0398981  normal  0.216121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1846  glycosyl transferase  28.85 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4221  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.775919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3057  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3130  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 1080 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.4 
 
 		 364 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3158  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  23.3 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3194  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  26.64 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 930 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 456 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 1079 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  29.86 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 		 371 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  27.64 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  21.56 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 		 967 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  22.62 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 822 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  21.56 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  26.83 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  27.27 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  26.83 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 		 357 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 383 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 383 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  25.95 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  22.02 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  25.76 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  37.1 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.27 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  19.76 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  26.13 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 1770 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>