More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0833 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  90.2 
 
 
358 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
357 aa  718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  61.43 
 
 
355 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  53.09 
 
 
361 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  53.41 
 
 
361 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  51.55 
 
 
375 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  38.14 
 
 
366 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
387 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  22.87 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.36 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
930 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.19 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  29.68 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.69 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.36 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.22 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.66 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.22 
 
 
769 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
389 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02458  Glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.772087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
394 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  21.55 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 
516 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  34.97 
 
 
507 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.86 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  34.56 
 
 
529 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
476 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  29.57 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.13 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
660 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  26.3 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>