More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3874 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  93.63 
 
 
361 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  100 
 
 
361 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  63.1 
 
 
375 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  53.69 
 
 
358 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  53.09 
 
 
357 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  54.24 
 
 
355 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  35.09 
 
 
366 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
373 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  29.18 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
930 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.98 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
1080 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.14 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0842  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.075779  hitchhiker  0.00456148 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  29.33 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  29.28 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02458  Glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.772087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.45 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  32.11 
 
 
513 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  29.13 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.49 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
739 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  27.44 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.73 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  32.84 
 
 
500 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.78 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
374 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.73 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
380 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
360 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.15 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  28.39 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  29.29 
 
 
374 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
377 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
386 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
374 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>