More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0811 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  93.63 
 
 
361 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
361 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  63.53 
 
 
375 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  53.41 
 
 
357 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  53.12 
 
 
358 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  54.8 
 
 
355 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  34.16 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
373 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
387 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
930 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.16 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.98 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  29.17 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.96 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.75 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  30.27 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  32.75 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.75 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.97 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
750 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02458  Glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.772087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.39 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
1080 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
376 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  29.57 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.49 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.67 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  28.89 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  24.05 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.49 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.28 
 
 
513 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  27.44 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.63 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.19 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  29.33 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
774 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0842  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.075779  hitchhiker  0.00456148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
395 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
502 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  32.84 
 
 
500 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
387 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
405 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.47 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
406 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>