More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4009 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 365 aa  756    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2166  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 468 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1310  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.039712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  26.44 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0220  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 370 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 439 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1063  glycosyltransferase  24.23 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.200763  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 1079 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.67 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 1080 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.92 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.57 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  21.99 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  24.41 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.28 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  26.21 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.81 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.26 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  22.26 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  22.26 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  22.26 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.26 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.26 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0288  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  26.69 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.59 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.98 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.72 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.94 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  23.54 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 856 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27880  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  29.8 
 
 		 1269 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.893451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  30.2 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.5 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>