More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2166 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2166  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
468 aa  922    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485753  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1310  glycosyl transferase, group 1  62.72 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.039712  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
365 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
377 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
370 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  26.96 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
365 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0220  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
380 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
382 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.26 
 
 
370 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
401 aa  84  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.44 
 
 
378 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  34.18 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  37.18 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  26.69 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  31.94 
 
 
369 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 
369 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.27 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  21.1 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
385 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  34.78 
 
 
364 aa  64.7  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
411 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
367 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
412 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
412 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.28 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
377 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5176  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
394 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
387 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  26.09 
 
 
350 aa  63.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.23 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
353 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.53 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  24.08 
 
 
358 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
367 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
364 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  26.09 
 
 
350 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
345 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  34.21 
 
 
353 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
391 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
365 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  25.3 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
364 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 
327 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
366 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  29.27 
 
 
366 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
357 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.26 
 
 
427 aa  60.5  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
409 aa  60.1  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  24.26 
 
 
430 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 
384 aa  60.1  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
344 aa  60.1  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
373 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.41 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  22.17 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
540 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
385 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  29.51 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  25.54 
 
 
350 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
388 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>