More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02467 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  100 
 
 		 365 aa  745    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  44.51 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  43.89 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  42.27 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  42.15 
 
 		 370 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  44.54 
 
 		 373 aa  292  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  40.16 
 
 		 394 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  41 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 		 400 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  38.11 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  25.28 
 
 		 379 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  26.24 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  21.67 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  23.18 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  23.94 
 
 		 399 aa  95.9  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  24.65 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  23.44 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  23.36 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.18 
 
 		 935 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  23.29 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  24.54 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 816 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  22.78 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  26.15 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.49 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  22.36 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  23.54 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  26.84 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  27.99 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.08 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  27.27 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  23.42 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  25.63 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  21.37 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 672 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>