68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3051 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
363 aa  755    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  52.38 
 
 
352 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  52.27 
 
 
351 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  49.17 
 
 
402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  49.16 
 
 
360 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  48.48 
 
 
399 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  34.35 
 
 
379 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  33.61 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  34.07 
 
 
399 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  33.15 
 
 
368 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  32.07 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  30.03 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  32.15 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  31.61 
 
 
365 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  33.43 
 
 
394 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  31.51 
 
 
380 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  32.01 
 
 
816 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  31.78 
 
 
368 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  30.54 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  26.84 
 
 
396 aa  126  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  27.32 
 
 
384 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  26.75 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
370 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
375 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
370 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.46 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  22.36 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  21.41 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.8 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.8 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.8 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6748  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
1241 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
346 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  33.62 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  21.55 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
408 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  33.62 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  28.57 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
1398 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
818 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.33 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.58 
 
 
384 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.36 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
831 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  20.37 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 
344 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>