133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  100 
 
 
379 aa  758    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  61.01 
 
 
399 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  59.95 
 
 
380 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  58.9 
 
 
421 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  42.74 
 
 
395 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
352 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  35.18 
 
 
373 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  33.88 
 
 
816 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  36.41 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
351 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  35.08 
 
 
380 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  33.15 
 
 
368 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  33.7 
 
 
402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  33.33 
 
 
368 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  33.15 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  29.82 
 
 
399 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.19 
 
 
382 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  28.95 
 
 
402 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
360 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  27.3 
 
 
384 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  29.56 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
387 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  24.51 
 
 
365 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
368 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
398 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
370 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  22.56 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  20.26 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  27.91 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
366 aa  54.3  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
822 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  25.27 
 
 
396 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  25.43 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.73 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
342 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  19.62 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
391 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
343 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
408 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  28.18 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  24.46 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  21.26 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
452 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.54 
 
 
388 aa  47.8  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  25.42 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  27.87 
 
 
415 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
389 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
415 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
394 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
434 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.83 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.57 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>