55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1781 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  100 
 
 		 365 aa  747    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  65.37 
 
 		 368 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  57.81 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  51.92 
 
 		 816 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  54.21 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  51.68 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  46.85 
 
 		 373 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  40.33 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  35.16 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  36.41 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  33.06 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  32.69 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  30.73 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  29 
 
 		 399 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  28.94 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  27.2 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  26.7 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  24.87 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.36 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  20.79 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 672 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  22.16 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 535 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>