76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0887 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  100 
 
 
399 aa  783    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  68.27 
 
 
380 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  64.52 
 
 
421 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  62.29 
 
 
379 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  39.61 
 
 
395 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  31.61 
 
 
402 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  36.78 
 
 
368 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  30.98 
 
 
402 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
363 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
352 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  33.61 
 
 
368 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  32.71 
 
 
816 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  28.94 
 
 
399 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  36.01 
 
 
394 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  30.47 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  32.69 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.05 
 
 
382 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  27.44 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  31.66 
 
 
380 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  28.86 
 
 
396 aa  149  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
360 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
387 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
394 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
398 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
373 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
400 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
375 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
370 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  24 
 
 
365 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
370 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.61 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  22.73 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
394 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
386 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
382 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
370 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
366 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
416 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
431 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
417 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  30.6 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  20.79 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  25 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.11 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  25.61 
 
 
375 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  31.25 
 
 
793 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
445 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0354  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
343 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  22.03 
 
 
368 aa  43.1  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  24.39 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>