87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2169 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 395 aa  805    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  42.74 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  39.61 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  41.82 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  41.13 
 
 		 421 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  42.73 
 
 		 816 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  39.19 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  39.29 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  39.95 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  38.96 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  36.99 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  39.61 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  33.24 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  33.42 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  31.75 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  31.09 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  31.07 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  30.35 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  26.17 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.82 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  21.7 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  26.87 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  25.49 
 
 		 793 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1887  mannosyltransferase  32.14 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1447  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000198609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.97 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  23.81 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 385 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.13 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  25.35 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  25.35 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  26.7 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2690  group 1 glycosyl transferase  26.23 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.823218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>