41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1423 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  100 
 
 
384 aa  799    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  63.35 
 
 
382 aa  528  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  57.25 
 
 
402 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  47.44 
 
 
396 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  31.75 
 
 
395 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  29.09 
 
 
380 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  27.44 
 
 
399 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  27.91 
 
 
373 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
352 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  27.56 
 
 
379 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  30.29 
 
 
399 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  33.72 
 
 
421 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  27.58 
 
 
816 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  28.95 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  25.13 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
363 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  25.66 
 
 
380 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  24.87 
 
 
365 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  25.06 
 
 
368 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  24.42 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  20.67 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
370 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  21.69 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  21.67 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  20.47 
 
 
365 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  21.96 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  21.96 
 
 
375 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
346 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>