44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5479 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  54.21 
 
 		 365 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  48.9 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  50.42 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  48.93 
 
 		 816 aa  315  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  49.86 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  43.8 
 
 		 373 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  39.19 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  34.89 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  30.24 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  33.24 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  29.32 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  34.59 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  31.66 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  25.78 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  26.99 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.63 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  25.66 
 
 		 384 aa  121  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 387 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  24.54 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  21.82 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  26.32 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 476 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>