35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1437 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  100 
 
 
382 aa  799    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  63.35 
 
 
384 aa  528  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  57.36 
 
 
402 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  52.56 
 
 
396 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  31.09 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  28.19 
 
 
379 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  28.2 
 
 
380 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
352 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  28.05 
 
 
399 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
351 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  27.63 
 
 
421 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  27.65 
 
 
373 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  27.84 
 
 
816 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  27.2 
 
 
394 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  26.7 
 
 
365 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  28.94 
 
 
399 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  29.77 
 
 
402 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  27.63 
 
 
380 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  26.51 
 
 
368 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  26.32 
 
 
368 aa  123  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
363 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.59 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  22.58 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  21.66 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 
400 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1814  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>