51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16220 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  759    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  57.81 
 
 		 365 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  56.13 
 
 		 368 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  50.54 
 
 		 816 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  50.42 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  48.26 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  44.75 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  39.29 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  36.78 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  35.46 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  29.86 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  32.33 
 
 		 421 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  30.22 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  27.51 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  26.51 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  27.69 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  25.06 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  21.85 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  22.56 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  21.35 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  20.53 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 424 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  22.98 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>