54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4445 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  100 
 
 		 421 aa  851    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  64.52 
 
 		 399 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  65.05 
 
 		 380 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  58.9 
 
 		 379 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  41.13 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 816 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  32.78 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  35.39 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  31.87 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  29.5 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 351 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  33.24 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  32.33 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  28 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  31.59 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  28.65 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  28.72 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.63 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  29.34 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 367 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 370 aa  97.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.75 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.85 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  21.92 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  27.5 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.15 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  19.33 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  29.49 
 
 		 793 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.03 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 370 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 370 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>