119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5357 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  779    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  53.83 
 
 		 816 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  51.68 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  48.92 
 
 		 368 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  46.98 
 
 		 368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  49.2 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  46.17 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  40.33 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 360 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  35.61 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  35.39 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  34.36 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  29.4 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  27.54 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  33.7 
 
 		 379 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  30.91 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.95 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  25.13 
 
 		 384 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.36 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  21.66 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  21.3 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  20.83 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  25.18 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  22.59 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 358 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  28.27 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.04 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.25 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.36 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 385 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3298  WcbE  28.89 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00149764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3250  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3285  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  26.37 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  24.58 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  30 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  30 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  30 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  30 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  30 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  42.31 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>