More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0592 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  89.16 
 
 
370 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
370 aa  762    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  70.27 
 
 
370 aa  554  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  66.76 
 
 
376 aa  528  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  49.05 
 
 
373 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  46.99 
 
 
368 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  42.7 
 
 
365 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  42.43 
 
 
394 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  41.29 
 
 
375 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
400 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
398 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
387 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
363 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  25.45 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  25.34 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
351 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  25.4 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  23.47 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
352 aa  92.8  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
360 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  23.5 
 
 
402 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  23.3 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
375 aa  86.3  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
370 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  26.56 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  27.89 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  24.11 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.75 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  26.67 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  26.67 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  25.59 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.83 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
394 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  26.36 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.8 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  28.4 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  25.96 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  25.77 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  21.73 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1050  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.806851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  26.46 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  28.82 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  25.91 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  28 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  23.98 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  24.08 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.2 
 
 
935 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  26.75 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  29.46 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  24.66 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  29.1 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>