More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0053 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 368 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  53.37 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  46.36 
 
 		 370 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  46.99 
 
 		 370 aa  325  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  46.11 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  45.63 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  44.51 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 		 400 aa  302  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  42.74 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  41.89 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  28.34 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  26.54 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  26.33 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  24.73 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  25.39 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  23.06 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.33 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 414 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.1 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  27.12 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.81 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  26.75 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  25.75 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 1261 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  24.35 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 838 aa  79.3  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  25.47 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.12 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  22.87 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  22.38 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  25.09 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  23.27 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  22.32 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.07 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 850 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  27.74 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  24.37 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25.06 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  24.39 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  27.54 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.66 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>