More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0450 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 376 aa  777    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  66.76 
 
 		 370 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  66.67 
 
 		 370 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  65.23 
 
 		 370 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  46.11 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  46.07 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  41.99 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 		 394 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 		 375 aa  272  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  39.2 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  23.82 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  25.47 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  23.61 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  22.56 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  26.08 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  22.48 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.09 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  25.55 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.42 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  21.33 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  23.75 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  21.98 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  33.83 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  23.42 
 
 		 816 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  21.82 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  26.04 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  24.74 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  23.82 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.22 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 846 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.57 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.79 
 
 		 935 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  28.11 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.92 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  25.45 
 
 		 846 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>