40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2826 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 351 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  62.22 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  51.57 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  48.6 
 
 		 399 aa  342  4e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  44.07 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  45.89 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  28.69 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  33.95 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  31.02 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  33.64 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  29.69 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  30.92 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  31.49 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  30.43 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  28.26 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  30.68 
 
 		 816 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  32.22 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  30.58 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  30.36 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  30.59 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  27.67 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  27.76 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  26.91 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 370 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 398 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.65 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  30.19 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  30.19 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1043  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>