47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0586 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
360 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  49.16 
 
 
363 aa  358  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  46.88 
 
 
352 aa  345  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  44.07 
 
 
351 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  41.46 
 
 
402 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  40.5 
 
 
399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  35.69 
 
 
395 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  33.6 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  36.39 
 
 
394 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  34.43 
 
 
368 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  34.14 
 
 
365 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  37.09 
 
 
380 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  34.16 
 
 
816 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  32.89 
 
 
373 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  34.42 
 
 
380 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  34.08 
 
 
379 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  28.79 
 
 
402 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  32.97 
 
 
399 aa  149  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  31.48 
 
 
421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  29.31 
 
 
396 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.16 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  25.39 
 
 
384 aa  119  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
375 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
370 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
370 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
373 aa  89.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  22.55 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  22.61 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
375 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
416 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
386 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
818 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>