More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0255 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
411 aa  810    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  44.79 
 
 
394 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  43.44 
 
 
400 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  45.19 
 
 
367 aa  305  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  42.97 
 
 
375 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
368 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
370 aa  245  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
370 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
370 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  32.75 
 
 
376 aa  231  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  32.4 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
398 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  27.37 
 
 
379 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  27.72 
 
 
399 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  29.11 
 
 
380 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  27.99 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  27.89 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  25.45 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  24.94 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  20.57 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  26.63 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  27.27 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.3 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  25.15 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  26.16 
 
 
816 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  24.92 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  21.79 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  21.86 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  29.08 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
401 aa  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1397  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
368 aa  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
384 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
378 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  29.21 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  21.53 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  24.59 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.71 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  24.94 
 
 
375 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
354 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
471 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  21.78 
 
 
437 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  28.88 
 
 
358 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 
391 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 
358 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
417 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  23.97 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.63 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
390 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  26.51 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
507 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  28.71 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>