More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4357 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 400 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  61.05 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  55.5 
 
 		 375 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  42.08 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  43.44 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 		 368 aa  302  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  42.51 
 
 		 373 aa  282  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  39.2 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 370 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  37.87 
 
 		 365 aa  249  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 398 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  29.83 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  30.25 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  26.76 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  28.26 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  27.76 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  25.91 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  28.26 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  27.3 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  27.1 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  26.34 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.7 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.59 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  24.46 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  23.87 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  25.94 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.09 
 
 		 513 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.34 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.86 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1232 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.05 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  25.85 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.04 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.15 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.37 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.1 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  27.18 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  27.79 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.47 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  24.62 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.86 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  32.04 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>