49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0206 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  100 
 
 		 402 aa  830    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  57.36 
 
 		 382 aa  442  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  57.25 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  49.1 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  31.61 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  35.7 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  28.9 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  33.42 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  32.26 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  27.54 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  28.42 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 363 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  28.83 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  28.94 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 816 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  25.78 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  27.51 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  28.35 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.45 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  24.65 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  21.05 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  22.05 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  21.83 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  32.71 
 
 		 368 aa  43.9  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>