88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3145 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  100 
 
 
402 aa  837    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  56.42 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  49.17 
 
 
363 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  45.89 
 
 
351 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  42.7 
 
 
352 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  41.46 
 
 
360 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  33.24 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  30.98 
 
 
399 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  33.7 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  29.5 
 
 
421 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  31.96 
 
 
373 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  32.26 
 
 
402 aa  168  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  30.24 
 
 
380 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  32.23 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  31.15 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  30.58 
 
 
368 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  32.33 
 
 
394 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  30.16 
 
 
816 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  30.22 
 
 
368 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  29.77 
 
 
382 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  29.12 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  28.95 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
370 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
370 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  22.79 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  22.48 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  22.48 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.03 
 
 
857 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
358 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  26.71 
 
 
365 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
411 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
828 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3058  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.23 
 
 
856 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 
856 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  25.23 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.02 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.23 
 
 
820 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.23 
 
 
820 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  24.23 
 
 
820 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  24.23 
 
 
820 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  30.15 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  25.71 
 
 
820 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
818 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.68 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
354 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
386 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  24.06 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  31.07 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  31.07 
 
 
407 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
1267 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
409 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  25.25 
 
 
372 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>