More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1043 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1043  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
364 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.82 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
378 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
378 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
376 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
376 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  25.45 
 
 
374 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
372 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
372 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
394 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
371 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  25.86 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
395 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  25.75 
 
 
375 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
366 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
382 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.78 
 
 
351 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
382 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  22.37 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  22.37 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.66 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
366 aa  89.4  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
398 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  24.22 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  24.83 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  24.28 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  27.65 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  22.41 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  22.41 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
2490 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  24.42 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  23.3 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  24.43 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  29.52 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  25.99 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
1770 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
850 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.84 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  23.53 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>