48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4249 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  100 
 
 		 373 aa  773    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  46.01 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  46.65 
 
 		 816 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  46.85 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  44.75 
 
 		 368 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  46.17 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  43.99 
 
 		 380 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  36.99 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  35.18 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  31.06 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  32.51 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  30.19 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  30.87 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  30 
 
 		 399 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  28.83 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  27.91 
 
 		 384 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  26.94 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.65 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  26.44 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  21.17 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  21.33 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  21.04 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  20.39 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  26.22 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 370 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 370 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.45 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>