90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0995 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  100 
 
 
380 aa  752    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  68.27 
 
 
399 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  65.05 
 
 
421 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  60.83 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  39.95 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  35.6 
 
 
816 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  35.16 
 
 
365 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  34.9 
 
 
368 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  35.46 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  28.9 
 
 
402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
363 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  29.09 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  34.78 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
352 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
360 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  30.87 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  31.15 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  28.88 
 
 
399 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.2 
 
 
382 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  34.59 
 
 
380 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  26.88 
 
 
396 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 
387 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
368 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
394 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
367 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
373 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  22.4 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.82 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
370 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
411 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
431 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  22.67 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2136  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  22.73 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  22.73 
 
 
337 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.03 
 
 
367 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
371 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  20.69 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  25.43 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  18.46 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  25.43 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  26.48 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
384 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  20.86 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  21.66 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.05 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
756 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  19.92 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 
435 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  25.6 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  44.9 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
846 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  23.39 
 
 
373 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  25.95 
 
 
846 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
395 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  28.12 
 
 
473 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  27.39 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  25.87 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>