More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3184 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
337 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  85.76 
 
 
337 aa  597  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  85.46 
 
 
337 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  43.8 
 
 
354 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
367 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
373 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  38.03 
 
 
2490 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
386 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
370 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
435 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
1043 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
442 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
375 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
377 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
442 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
387 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
387 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
1739 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  31.65 
 
 
501 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
1770 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
370 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
360 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
357 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.19 
 
 
380 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
370 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
361 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
384 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
376 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
374 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
382 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
394 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
393 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
371 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
366 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.06 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  28.27 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  29.3 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
377 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.5 
 
 
372 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  28.13 
 
 
364 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
373 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
398 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.14 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
428 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
384 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
382 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  27.68 
 
 
375 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
380 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.53 
 
 
375 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.43 
 
 
336 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
355 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
420 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.77 
 
 
361 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
379 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.27 
 
 
375 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
371 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
437 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
367 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
375 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
372 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
392 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
381 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
431 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
376 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
393 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
417 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
380 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
360 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
380 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
366 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
373 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3536  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
376 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
364 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.1 
 
 
381 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  29.32 
 
 
353 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
378 aa  99  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
535 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>