More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1900 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  64.09 
 
 
355 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  64.48 
 
 
343 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  58.81 
 
 
336 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  54.94 
 
 
458 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0545  glycosyl transferase group 1  54.63 
 
 
337 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  54.19 
 
 
336 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3373  glycosyl transferase group 1  53.03 
 
 
331 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000273398  normal  0.0134902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  43.49 
 
 
339 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 
355 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 
363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  41.35 
 
 
349 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  40.41 
 
 
355 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
355 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.4 
 
 
354 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.4 
 
 
354 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.4 
 
 
400 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
354 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  39.47 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  38.62 
 
 
357 aa  245  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
354 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  38.84 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  40.06 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.83 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.77 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.83 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.83 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.83 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 
356 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  37.93 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
354 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  38.12 
 
 
365 aa  242  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
354 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  38.4 
 
 
360 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  39.19 
 
 
354 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  39.48 
 
 
372 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  40.52 
 
 
363 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  40.82 
 
 
366 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.08 
 
 
354 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 
374 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  37.83 
 
 
349 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  39.54 
 
 
355 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 
354 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
354 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
354 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 
354 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
354 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
354 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 
365 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
377 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
377 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
377 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 
417 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 
365 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
344 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  39.44 
 
 
356 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
364 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
408 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
376 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 
362 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  38.53 
 
 
370 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
354 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  39 
 
 
364 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
354 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.57 
 
 
354 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
374 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  38.97 
 
 
355 aa  225  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
355 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  38 
 
 
355 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.61 
 
 
354 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  39.09 
 
 
373 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  37.61 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  40.35 
 
 
361 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 
373 aa  222  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3151  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
376 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  35.49 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
359 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 
354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  36.66 
 
 
362 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>