More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3180 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 370 aa  765    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  70.27 
 
 		 370 aa  554  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  71.23 
 
 		 370 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  65.23 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  48.92 
 
 		 373 aa  328  7e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  46.36 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  43.33 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  45.26 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  44.35 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  41.4 
 
 		 394 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 		 400 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  26.01 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  24.66 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 354 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  23.59 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  22.53 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  22.95 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.97 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  22.85 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.49 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.98 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.42 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  22.92 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  21.35 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  24.86 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  20.77 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  23.14 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  22.39 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  24.6 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  25.07 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.57 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  22.15 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  22.51 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  22.51 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0960  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1050  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.806851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.82 
 
 		 935 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.28 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  25.97 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  22.52 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.73 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  29.69 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  23.78 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>