More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1364 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  100 
 
 
388 aa  761    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  81.77 
 
 
377 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  61.92 
 
 
388 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  58.47 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  60.38 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  58.62 
 
 
388 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  59.62 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  54.79 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  56.1 
 
 
391 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  57.77 
 
 
401 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  58.01 
 
 
375 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.06 
 
 
385 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  56.71 
 
 
375 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  56.76 
 
 
386 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.85 
 
 
381 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1788  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  57.38 
 
 
386 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  55.31 
 
 
404 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.41 
 
 
402 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 
400 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.53 
 
 
384 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.8 
 
 
376 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  55.86 
 
 
371 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.48 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.48 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  53.48 
 
 
374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  55.28 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  52.99 
 
 
435 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2291  glycosyl transferase group 1  53.15 
 
 
374 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  52.62 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1923  glycosyl transferase group 1  52.88 
 
 
374 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
370 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15390  glycosyltransferase  39.55 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.68 
 
 
370 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
370 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.31 
 
 
382 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.96 
 
 
396 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
382 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  33.78 
 
 
382 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.27 
 
 
775 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  40.82 
 
 
385 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.9 
 
 
374 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4807  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.15 
 
 
372 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.99 
 
 
367 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.13 
 
 
379 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.59 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.13 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
367 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.87 
 
 
375 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.82 
 
 
381 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
355 aa  123  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
373 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
377 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
392 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
446 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
414 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
419 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0448  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
381 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.42 
 
 
392 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  32.8 
 
 
367 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
410 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
399 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
384 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05020  glycosyltransferase  31.3 
 
 
387 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
353 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
536 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
404 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25.32 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
419 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.18 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
357 aa  92.8  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
413 aa  92.8  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
376 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.9 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.33 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.5 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
456 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.16 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
386 aa  90.9  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
375 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>