More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0235 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 365 aa  760    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  80.43 
 
 		 373 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  83.19 
 
 		 373 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  68.42 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  64.51 
 
 		 362 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  61.89 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  52.35 
 
 		 354 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  50.87 
 
 		 355 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  51.46 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  48.97 
 
 		 359 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  49.57 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  51.61 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  51.32 
 
 		 354 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  51.32 
 
 		 354 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  51.32 
 
 		 354 aa  335  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  50.73 
 
 		 356 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.18 
 
 		 354 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.03 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.18 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  51.03 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  49.41 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.88 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  50.29 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.59 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.59 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.59 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.59 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  49.56 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 354 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  49.71 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  49.57 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  48.82 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  50.73 
 
 		 354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.99 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  46.9 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  50.44 
 
 		 354 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  47.21 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  48.99 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  49.12 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  50.88 
 
 		 355 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.26 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  48 
 
 		 370 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  51.75 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  49.56 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  51.75 
 
 		 377 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  48.26 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  46.92 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  47.63 
 
 		 355 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  46.31 
 
 		 354 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  50.58 
 
 		 377 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  49.71 
 
 		 365 aa  322  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  45.72 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  49.7 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  45.72 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  51.02 
 
 		 376 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  45.72 
 
 		 354 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  46.02 
 
 		 354 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  48.1 
 
 		 364 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.9 
 
 		 354 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  49.42 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  49.28 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  48.4 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.61 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  48.54 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 		 379 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  47.83 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  47.29 
 
 		 349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  46.47 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3151  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 376 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  48.29 
 
 		 359 aa  305  8.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  46.94 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  46.31 
 
 		 354 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  46.32 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  45.74 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  46.4 
 
 		 355 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 		 374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  42.69 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  44.51 
 
 		 357 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  42.52 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  48.45 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  43.06 
 
 		 458 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>