More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1410 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1410  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 384 aa  791    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  22.53 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0857  a-glycosyltransferase  25.19 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  24.63 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  25.09 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0797  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.77 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.3 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  23.63 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  22.43 
 
 		 358 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  22.36 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  21.41 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  21.41 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0055  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.557703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  27.87 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0148  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3204  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.81 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2536  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1933  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  26.5 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.83 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  23.79 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 930 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  20.71 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  21.9 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>