More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0288 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0288  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  757    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
394 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  25.08 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.43 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.63 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.16 
 
 
745 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
388 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  22.48 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.77 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  24.92 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  18.36 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.29 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  19.24 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.07 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  23.35 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  20.59 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  21.73 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  19.3 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  19.18 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  21.02 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  19.95 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  22.85 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  21.08 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  23.3 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.74 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.8 
 
 
367 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  22.71 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  20.54 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  17.65 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  19.17 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.81 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  21.69 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0474  phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  21.73 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  25.57 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  31.94 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  25.84 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.28 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.54 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  21.87 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  24.92 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  20.74 
 
 
401 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  21.15 
 
 
375 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  22.45 
 
 
369 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  25.49 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.11 
 
 
369 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.27 
 
 
358 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.11 
 
 
369 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>