More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6871 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  760    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  53.28 
 
 
385 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 
375 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  30.52 
 
 
364 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
379 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0361  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
354 aa  122  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.37 
 
 
935 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
408 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
414 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 
446 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
356 aa  103  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
414 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
390 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
396 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.29 
 
 
410 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
464 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
387 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  28.78 
 
 
417 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.24 
 
 
414 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
391 aa  92.8  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
413 aa  92.8  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
410 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.36 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  27.16 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
353 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
370 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
370 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
367 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
367 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.35 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
415 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  27.46 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
422 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.94 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  24.67 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.06 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 
536 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.72 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
425 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.87 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  25.2 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.61 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  27.39 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1983  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.95 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  23.46 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.02 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.7 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  27.6 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  28.95 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  27.31 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  26.63 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  26.72 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>