More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3848 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 375 aa  752    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 		 378 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  31.66 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.27 
 
 		 935 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  26.58 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 800 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  20.2 
 
 		 536 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 419 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  30.79 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.73 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  26.07 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.41 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  28.53 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  38.19 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0361  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  29.32 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  24.52 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  28.45 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.6 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  28.97 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  36.47 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.41 
 
 		 745 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>