More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1533 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  99.47 
 
 
380 aa  774    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  100 
 
 
380 aa  778    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  64.47 
 
 
380 aa  494  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  47.24 
 
 
390 aa  311  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  44.02 
 
 
392 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  42.93 
 
 
397 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  42.55 
 
 
392 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  20.95 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.67 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.06 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  27 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  24.37 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
391 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
476 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
398 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00195  glycosyltransferase  25.96 
 
 
399 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.799849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.47 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
435 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 
402 aa  59.7  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1122  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.775323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 
459 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.73 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
930 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3037  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.479562  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  26.33 
 
 
638 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
885 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
374 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.29 
 
 
406 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  26.36 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  29.95 
 
 
430 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  30.48 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
408 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  29.04 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.14 
 
 
396 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>