More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  100 
 
 
364 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  56.93 
 
 
407 aa  322  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20940  glycosyltransferase  47.71 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3892  glycosyl transferase group 1  48.99 
 
 
393 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476766  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
412 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
418 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
412 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
408 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
416 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.74 
 
 
409 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  20.2 
 
 
421 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
403 aa  86.3  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  23.8 
 
 
407 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
410 aa  85.9  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.49 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  29.39 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  31.91 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.85 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.76 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
517 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  36.47 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  29.46 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.17 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
421 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4434  hypothetical protein  29.66 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  29.06 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  25.84 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.6 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
904 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
768 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
436 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.05 
 
 
416 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.16 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
476 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22.43 
 
 
415 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
423 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
396 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0788  hypothetical protein  29.35 
 
 
464 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  22.63 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
434 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
439 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1970  hypothetical protein  29.43 
 
 
405 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0110365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
424 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
424 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  24.14 
 
 
429 aa  59.3  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
417 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  29.73 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>