More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1262 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
405 aa  833    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  51.12 
 
 
411 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  45.54 
 
 
422 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  42.82 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1983  glycosyltransferase  40.29 
 
 
417 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1376  glycosyl transferase group 1  40.89 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440172  hitchhiker  0.00926089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  42.32 
 
 
419 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  36.11 
 
 
397 aa  235  9e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
404 aa  225  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
410 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3505  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
408 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  35.29 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
421 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
412 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  29.2 
 
 
407 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
427 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
412 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
517 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  29.85 
 
 
429 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
418 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
418 aa  146  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 
413 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
424 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
424 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
441 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
403 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
413 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  25.75 
 
 
413 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
423 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
415 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
409 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  27.83 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
406 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  26.43 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.11 
 
 
409 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  22.85 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
405 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5445  Cap8L  24.29 
 
 
411 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  28.37 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
407 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
412 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
412 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
421 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
402 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
414 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
407 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  23.26 
 
 
401 aa  101  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
415 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
416 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  27.2 
 
 
420 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.94 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  25.92 
 
 
433 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  26.39 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3692  a-glycosyltransferase  22.41 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  26.77 
 
 
428 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  27.43 
 
 
415 aa  94  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  25.07 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
416 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4901  group 1 glycosyl transferase  25.51 
 
 
475 aa  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6293  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  32.15 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
436 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  23.74 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  25.06 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0146  glycosyl transferase, group 1  21.15 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0151  glycosyl transferase group 1  21.15 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2339  putative glycosyl transferase  28.65 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2231  putative glycosyl transferase  28.65 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2332  putative glycosyl transferase  28.37 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3198  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2288  putative glycosyl transferase  28.37 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907733  hitchhiker  0.00856405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2446  putative glycosyl transferase  28.37 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2612  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  25.3 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  30.03 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  26.91 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 
450 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  26.87 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0824  putative glycosyl transferase  24.93 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1282  glycosyltransferase-like protein  24.68 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>