56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3712 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  818    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  31.37 
 
 
411 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  30.56 
 
 
399 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  29.93 
 
 
416 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  27.01 
 
 
420 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.73 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
436 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 
406 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  25 
 
 
364 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 
402 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
768 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1495  hypothetical protein  28.11 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1931  hypothetical protein  22.61 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.35 
 
 
383 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  22.41 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  23.19 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
441 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
859 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  20.39 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
378 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  20.48 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  21.96 
 
 
394 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  22.45 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3508  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8743499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  26.77 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
370 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
397 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
389 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>