123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3346 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 420 aa  857    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  27.01 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1495  hypothetical protein  30.22 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  25.15 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  29.47 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  24.23 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.2 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  20.87 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00694  hypothetical protein  21.55 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  26.21 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1931  hypothetical protein  24 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.45 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 575 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  25.59 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  25.27 
 
 		 723 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  19.05 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0698  hypothetical protein  25.66 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 817 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 395 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  22.14 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 768 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.46 
 
 		 557 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.02 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  21.05 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  48.94 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.46 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  23.11 
 
 		 1188 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  20.44 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  24.7 
 
 		 564 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  22.59 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  23.31 
 
 		 569 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  21.66 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2386  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.22 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  19.69 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>