More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1854 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 377 aa  734    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  28.43 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  28.67 
 
 		 433 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.43 
 
 		 432 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 		 424 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 859 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  36.27 
 
 		 484 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 		 463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 519 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  22.99 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 		 550 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 516 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 507 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 522 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 540 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 447 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  24.83 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  24.83 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.23 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  33.08 
 
 		 861 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  30.41 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 545 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.45 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 420 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.73 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.94 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  23.55 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32.57 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  29.36 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.77 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  27.95 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  20.77 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01298  predicted glycosyltransferase  26.35 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.65788  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  28.06 
 
 		 564 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  26.24 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  36.72 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.35 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  31.5 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8511  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0190173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  19.42 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>